Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24BO95487 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms