Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEMFO60524 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMFO60524 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMFO60524 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMFO60524 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMFO60524 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMFO60524 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMFO60524 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMFO60524 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMFO60524 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMFO60524 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMFO60524 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEMFO60524 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEMFO60524 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEMFO60524 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms