Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

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Length 106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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NDUFS5O43920 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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NDUFS5O43920 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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NDUFS5O43920 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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NDUFS5O43920 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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NDUFS5O43920 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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NDUFS5O43920 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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NDUFS5O43920 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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NDUFS5O43920 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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NDUFS5O43920 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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