Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC25A20O43772 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms