Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNGR2O43760 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms