Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms