Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRXO43186 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRXO43186 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRXO43186 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRXO43186 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRXO43186 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRXO43186 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRXO43186 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRXO43186 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRXO43186 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRXO43186 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CRXO43186 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CRXO43186 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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