Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEFVO15553 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MEFVO15553 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MEFVO15553 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MEFVO15553 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MEFVO15553 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MEFVO15553 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEFVO15553 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MEFVO15553 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MEFVO15553 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MEFVO15553 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEFVO15553 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms