Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN34H7C241 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms