Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC169A6NNP5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms