Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8B2A6NJW9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms