Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms