Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms