Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
V9GYV3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
V9GYV3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
V9GYV3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
V9GYV3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
V9GYV3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
V9GYV3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
V9GYV3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
V9GYV3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
V9GYV3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
V9GYV3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
V9GYV3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
V9GYV3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
V9GYV3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
V9GYV3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
V9GYV3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
V9GYV3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
V9GYV3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
V9GYV3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
V9GYV3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
V9GYV3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
V9GYV3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
V9GYV3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
V9GYV3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
V9GYV3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
V9GYV3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
V9GYV3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
V9GYV3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
V9GYV3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
V9GYV3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
V9GYV3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
V9GYV3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
V9GYV3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
V9GYV3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
V9GYV3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
V9GYV3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYV3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYV3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYV3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYV3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYV3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYV3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYV3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYV3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYV3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYV3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYV3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYV3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYV3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYV3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYV3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYV3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYV3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYV3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYV3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYV3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYV3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYV3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYV3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYV3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYV3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYV3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYV3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
V9GYV3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
V9GYV3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYV3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYV3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYV3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYV3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYV3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYV3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYV3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYV3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYV3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYV3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYV3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYV3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYV3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYV3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYV3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYV3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYV3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYV3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYV3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYV3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
V9GYV3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
V9GYV3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
V9GYV3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
V9GYV3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
V9GYV3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
V9GYV3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
V9GYV3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
V9GYV3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
V9GYV3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
V9GYV3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
V9GYV3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
V9GYV3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
V9GYV3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
V9GYV3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
V9GYV3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms