Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B5

MTCL1, Microtubule cross-linking factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCL1Q9Y4B5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTCL1Q9Y4B5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTCL1Q9Y4B5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTCL1Q9Y4B5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTCL1Q9Y4B5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTCL1Q9Y4B5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTCL1Q9Y4B5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTCL1Q9Y4B5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms