Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R5

DOPEY2, Protein dopey-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOPEY2Q9Y3R5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DOPEY2Q9Y3R5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DOPEY2Q9Y3R5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DOPEY2Q9Y3R5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DOPEY2Q9Y3R5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DOPEY2Q9Y3R5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms