Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C5

RNF11, RING finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF11Q9Y3C5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF11Q9Y3C5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF11Q9Y3C5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF11Q9Y3C5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF11Q9Y3C5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms