Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A6Q9Y289 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A6Q9Y289 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A6Q9Y289 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms