Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCE1Q9Y256 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCE1Q9Y256 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms