Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX7Q9UNH6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX7Q9UNH6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX7Q9UNH6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms