Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms