Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT8

HECTD1, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1, humanhuman

Predictions only

Length 2,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1Q9ULT8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECTD1Q9ULT8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECTD1Q9ULT8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECTD1Q9ULT8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HECTD1Q9ULT8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HECTD1Q9ULT8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms