Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO4Q9UKT5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO4Q9UKT5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO4Q9UKT5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms