Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TUBE1Q9UJT0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TUBE1Q9UJT0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TUBE1Q9UJT0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TUBE1Q9UJT0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TUBE1Q9UJT0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TUBE1Q9UJT0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TUBE1Q9UJT0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TUBE1Q9UJT0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TUBE1Q9UJT0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TUBE1Q9UJT0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBE1Q9UJT0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBE1Q9UJT0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TUBE1Q9UJT0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TUBE1Q9UJT0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TUBE1Q9UJT0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TUBE1Q9UJT0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBE1Q9UJT0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms