Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNA1Q9UIW2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLXNA1Q9UIW2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLXNA1Q9UIW2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms