Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAX2Q9UIW0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAX2Q9UIW0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAX2Q9UIW0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms