Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ6

SHPK, Sedoheptulokinase, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPKQ9UHJ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHPKQ9UHJ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPKQ9UHJ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPKQ9UHJ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms