Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMTOR3Q9UHA4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMTOR3Q9UHA4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMTOR3Q9UHA4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms