Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNN3Q9UGI6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNN3Q9UGI6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNN3Q9UGI6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNN3Q9UGI6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN3Q9UGI6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms