Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
IFT172Q9UG01 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
IFT172Q9UG01 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
IFT172Q9UG01 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
IFT172Q9UG01 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
IFT172Q9UG01 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
IFT172Q9UG01 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
IFT172Q9UG01 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
IFT172Q9UG01 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
IFT172Q9UG01 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
IFT172Q9UG01 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
IFT172Q9UG01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
IFT172Q9UG01 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
IFT172Q9UG01 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
IFT172Q9UG01 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
IFT172Q9UG01 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
IFT172Q9UG01 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
IFT172Q9UG01 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
IFT172Q9UG01 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms