Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
RIMBP3Q9UFD9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
RIMBP3Q9UFD9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
RIMBP3Q9UFD9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
RIMBP3Q9UFD9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
RIMBP3Q9UFD9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
RIMBP3Q9UFD9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
RIMBP3Q9UFD9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
RIMBP3Q9UFD9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
RIMBP3Q9UFD9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC42.57■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC42.52■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
RIMBP3Q9UFD9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC42.5■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC42.49■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
RIMBP3Q9UFD9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
RIMBP3Q9UFD9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
RIMBP3Q9UFD9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
RIMBP3Q9UFD9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
RIMBP3Q9UFD9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
RIMBP3Q9UFD9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
RIMBP3Q9UFD9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
RIMBP3Q9UFD9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
RIMBP3Q9UFD9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
RIMBP3Q9UFD9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
RIMBP3Q9UFD9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
RIMBP3Q9UFD9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
RIMBP3Q9UFD9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
RIMBP3Q9UFD9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
RIMBP3Q9UFD9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
RIMBP3Q9UFD9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
RIMBP3Q9UFD9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
RIMBP3Q9UFD9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
RIMBP3Q9UFD9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
RIMBP3Q9UFD9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
RIMBP3Q9UFD9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
RIMBP3Q9UFD9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
RIMBP3Q9UFD9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
RIMBP3Q9UFD9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
RIMBP3Q9UFD9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
RIMBP3Q9UFD9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC42.29■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.29■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
RIMBP3Q9UFD9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
RIMBP3Q9UFD9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
RIMBP3Q9UFD9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
RIMBP3Q9UFD9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
RIMBP3Q9UFD9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
RIMBP3Q9UFD9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
RIMBP3Q9UFD9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RIMBP3Q9UFD9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RIMBP3Q9UFD9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
RIMBP3Q9UFD9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
RIMBP3Q9UFD9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
RIMBP3Q9UFD9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
RIMBP3Q9UFD9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
RIMBP3Q9UFD9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
RIMBP3Q9UFD9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
RIMBP3Q9UFD9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
RIMBP3Q9UFD9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
RIMBP3Q9UFD9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
RIMBP3Q9UFD9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms