Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK4Q9UBT3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DKK4Q9UBT3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK4Q9UBT3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms