Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPB1Q9UBR1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UPB1Q9UBR1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPB1Q9UBR1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UPB1Q9UBR1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPB1Q9UBR1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPB1Q9UBR1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPB1Q9UBR1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPB1Q9UBR1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPB1Q9UBR1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UPB1Q9UBR1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPB1Q9UBR1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPB1Q9UBR1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPB1Q9UBR1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPB1Q9UBR1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPB1Q9UBR1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPB1Q9UBR1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPB1Q9UBR1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms