Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
XCL2Q9UBD3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XCL2Q9UBD3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XCL2Q9UBD3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms