Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP1Q9P0U3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SENP1Q9P0U3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SENP1Q9P0U3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP1Q9P0U3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms