Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU0

FLRT3, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT3Q9NZU0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FLRT3Q9NZU0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FLRT3Q9NZU0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLRT3Q9NZU0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLRT3Q9NZU0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms