Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIC8BQ9NVN3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIC8BQ9NVN3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms