Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL5

RYDEN, Repressor of yield of DENV protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYDENQ9NUL5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RYDENQ9NUL5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RYDENQ9NUL5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RYDENQ9NUL5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RYDENQ9NUL5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RYDENQ9NUL5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RYDENQ9NUL5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms