Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATG3Q9NT62 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ATG3Q9NT62 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATG3Q9NT62 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATG3Q9NT62 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATG3Q9NT62 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATG3Q9NT62 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATG3Q9NT62 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATG3Q9NT62 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATG3Q9NT62 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATG3Q9NT62 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATG3Q9NT62 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATG3Q9NT62 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATG3Q9NT62 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATG3Q9NT62 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ATG3Q9NT62 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATG3Q9NT62 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATG3Q9NT62 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATG3Q9NT62 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATG3Q9NT62 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATG3Q9NT62 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATG3Q9NT62 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATG3Q9NT62 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ATG3Q9NT62 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATG3Q9NT62 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATG3Q9NT62 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
ATG3Q9NT62 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATG3Q9NT62 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATG3Q9NT62 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ATG3Q9NT62 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATG3Q9NT62 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATG3Q9NT62 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATG3Q9NT62 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATG3Q9NT62 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ATG3Q9NT62 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATG3Q9NT62 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATG3Q9NT62 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ATG3Q9NT62 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATG3Q9NT62 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATG3Q9NT62 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATG3Q9NT62 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATG3Q9NT62 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATG3Q9NT62 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATG3Q9NT62 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ATG3Q9NT62 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATG3Q9NT62 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms