Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPOLBQ9NRJ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPOLBQ9NRJ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPOLBQ9NRJ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PAPOLBQ9NRJ5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAPOLBQ9NRJ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms