Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLE4Q9NR33 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE4Q9NR33 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLE4Q9NR33 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms