Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYLDQ9NQC7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYLDQ9NQC7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CYLDQ9NQC7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYLDQ9NQC7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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