Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MED4Q9NPJ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED4Q9NPJ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED4Q9NPJ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MED4Q9NPJ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MED4Q9NPJ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms