Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRMS1Q9HCU9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRMS1Q9HCU9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRMS1Q9HCU9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 832.4 ms