Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLD4Q9HCU8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD4Q9HCU8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLD4Q9HCU8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLD4Q9HCU8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD4Q9HCU8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms