Protein–RNA interactions for Protein: Q9H930

SP140L, Nuclear body protein SP140-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140LQ9H930 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140LQ9H930 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP140LQ9H930 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP140LQ9H930 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms