Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLMPQ9H6B4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLMPQ9H6B4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLMPQ9H6B4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLMPQ9H6B4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLMPQ9H6B4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLMPQ9H6B4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLMPQ9H6B4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLMPQ9H6B4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms