Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC68Q9H2F9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC68Q9H2F9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC68Q9H2F9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC68Q9H2F9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms