Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LHX5Q9H2C1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LHX5Q9H2C1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LHX5Q9H2C1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX5Q9H2C1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX5Q9H2C1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX5Q9H2C1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX5Q9H2C1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX5Q9H2C1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX5Q9H2C1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX5Q9H2C1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX5Q9H2C1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX5Q9H2C1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
LHX5Q9H2C1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LHX5Q9H2C1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LHX5Q9H2C1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LHX5Q9H2C1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms