Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM117Q9H0C3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM117Q9H0C3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM117Q9H0C3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM117Q9H0C3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM117Q9H0C3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMEM117Q9H0C3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM117Q9H0C3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM117Q9H0C3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms